一个门牌号但是有两个户口本、有两个户主，如果拆迁，只需赔偿《房屋所有权证》上面登记的所有者。

根据《拆迁补偿条例》第十五条规定“房屋征收部门应当对房屋征收范围内房屋的权属、区位、用途、建筑面积等情况组织调查登记，被征收人应当予以配合。调查结果应当在房屋征收范围内向被征收人公布”。

在拆迁之前，相关部门组织调查，主要调查《房屋所有权证》，一个门牌号，在产权登记证书上只有一个所有者或夫妻二人共有。

拆迁以产权登记证书上的信息为主，其它相关证明，均不予认可。若有两个户主，如何分配拆迁补偿，可通过协商、司法程序解决。

案例：房屋拆迁。户主甲意外发现自家住房地址已被他人登记过了，2015年甲把全家迁到新城西路的一处房产，“此房是房改房，单位分房后1992年登记到甲，从来没有买卖过，现在迁过来只为方便孙女上学。”

同一个户口地址，却有两个不同的户主姓名。1993年甲爱人，转让该处房产给甲某，但因房改房五年内不能买卖，转让推迟。在户籍政策宽松的时期，乙拿着转让协议抵押合同办理了入户手续，也是合法的户口。

房屋产权登记证上写的名字是乙，最终法院判决房屋归乙所有，并获得全部补偿。

一宅两户拆迁中一户签字可能会影响另一户。因为一宅两户属于双方共同房产，拆迁时需要双方都签字同意。如果一方签字，另一方不知情，可能会影响后续的补偿安置协议分割、继承等问题。

以上内容仅供参考，建议咨询专业律师获取更准确的意见。

无论拆迁采取按照房屋面积安置、按照户头安置还是按照户口安置，一房多户的居民都应当按照房屋面积、户头数、户口数享受相应安置政策，不能因为大多数人都是一房一户，那么一房两户的人家的补偿安置就应该打折扣。

一个房子有两个户口拆迁的话分配办法内部可以协商，协商不成根据具体征收补偿方案、被安置对象情况等依法分割。法律允许一房两户的情况存在，那么，无论拆迁采取按照房屋面积安置、按照户头安置还是按照户口安置，一房多户的居民都应当按照房屋面积、户头数、户口数享受相应安置政策。如果在城市国有土地上房屋征收依据国务院590号令精神征收补偿是征收人对房屋所有权人进行补偿安置，与几个户口无关，对有户口的实际居住人属于无房户的可以按政策申请廉租房。房屋所有人被拆迁房屋面积大于安置房面积选择产权调换的，各地政府在房屋安置办法中都规定套靠户型的办法进行产权调换，被拆房屋大于安置房面积达到一定比例就可以增加一套房进行安置，增加一套房后大于拆一还一以上的面积，可以用适当的价格来调整，确保征收双方当事人的合法权益不受侵害。

1、第一种是按两户人的人口进行补偿;第二种是按户口取得两块用于建房的土地。

2、两户应当提前商量沟通，避免产生安置纠纷。

法律依据：

《中华人民共和国民法典》第三百零一条处分共有的不动产或者动产以及对共有的不动产或者动产作重大修缮、变更性质或者用途的，应当经占份额三分之二以上的按份共有人或者全体共同共有人同意，但是共有人之间另有约定的除外。

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